Το θεματολόγιο του τομέα αυτού, περιλαμβάνει τα έσοδα και έξοδα του Τμήματος, καθώς και τους ετήσιους προϋπολογισμούς. Έχει την ευθύνη για την κατάρτιση των προϋπολογισμών και μεριμνά για την έγκριση και τον έλεγχο της εφαρμογής τους. Φροντίζει και παρακολουθεί τις καταστάσεις και το επίπεδο των πιστώσεων, από μήνα σε μήνα και μεριμνά για την έγκριση συμπληρωματικών πιστώσεων, εκεί που τα εγκεκριμένα κονδύλια αποδεικνύονται ανεπαρκή.

Τα έσοδα και έξοδα του Τμήματος, κατά το έτος 2021 είναι:

Έσοδα:  €89.985.001,21

Έξοδα:  €65.811.019,26

Επίσης, ο τομέας ασχολείται με την κατάρτιση του μισθολογίου του προσωπικού και διενεργεί πληρωμές με βάση τα τιμολόγια. Επίσης, ο τομέας ασχολείται με την κατάρτιση του προϋπολογισμού βάσει δραστηριοτήτων, σε συνάρτηση πάντα με το στρατηγικό σχεδιασμό του Τμήματος. Αρμοδιότητα του τομέα είναι και η μετάβαση στο νέο δημοσιονομικό σύστημα ERP (Enterprise Resource Planning), αφού συντονίζει τις εργασίες που γίνονται προς το σκοπό αυτό.